コンホメーションが制限されたBODIPY染料は細胞イメージングに広く用いられ、各種の細胞構造と過程を可視化する。それらは共焦点顕微鏡、生細胞イメージングと超解像顕微鏡などの技術に応用でき、細胞成分の動態を追跡し、細胞形態を研究し、そして細胞過程をモニタリングする。
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1,3,5,7-tetramethyl-8-(4-methoxycarbonylmethyloxyphenyl)-4,4'-difluoroboradiazaindacene
1,2-bis-(5-[4-(2-{2-[2-(2-{2-methoxycarbomethoxy}-ethoxy)-ethoxy]-ethoxy}-ethoxy)-phenyl]-2-methyl-thiophene-3-yl)-perfluorocyclopentene