水溶性カリックスアレーンはイオン、有機小分子、さらにはより大きな生体分子を含む多種のゲスト分子と主ゲスト錯体を形成することができる。この錯形成作用は主に非共有相互作用によって推進され、例えば水素結合、ファンデルワールス力と疎水性相互作用である。 特定のゲスト分子に対する水溶性カリックスアレーンの選択性は、その官能基を変化させることによって調節することができる。これにより、選択的抽出、センサ、および分離プロセスを含む様々なアプリケーションにおいて価値がある。 いくつかの水溶性カリックスアレーンは、特定のゲスト分子に対する特定の結合部位を有し、これは、化学的および生物学的認識の面で有益である可能性がある。
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