ポリペプチドはCG塩基対を認識するように設計されてもよい。CG塩基対と高い親和性を有する配列をポリペプチドライブラリーからスクリーニングすることができる。これらのポリペプチドは、その結合の特異性および親和性を増強するようにさらに修飾することができる。
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1-{2-[3,5-bis-(3,5-di-tert-butyl-benzyloxy)-benzyl]-1,3-dioxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-5-yl}-3-hexyl-urea