オリゴヌクレオチドの5‘端から始めます。 3‘−ヒドロキシ基の保護には、通常、ジメトキシトリブチル(DMT)のような保護基が用いられる。 次に5‘末端を活性化するために、S-チオリン酸塩基を有する亜ホスファミド誘導体が一般的に使用される。
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5'-O-(tert-butyldiphenylsilyl)-3'-S-acetyl-3'-thiothymidine