ヌクレオシドの1つの3‘-OH基を保護して、早期反応を防止する。これは、一般に、ジメトキシトリフェニル(DMT)のような保護基に変換することによって達成される。
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N-[5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3'-amino-3'-deoxythymidin-3'-yl]-O-(3'-O-acetylthymidin-5'-yl)-methanephosphonamidate
Adenosine, N-benzoyl-5'-O-[bis(4-methoxyphenyl)phenylmethyl]-, 3'-benzoate