より大きなストークス変位(吸収波長と発光波長との間の差)は、一般に蛍光標識の第一選択である。自己消光の機会を減らし、より正確な画像化を可能にする。
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3-Ethyl-2-[(E)-2-(4-hydroxy-phenyl)-vinyl]-benzothiazol-3-ium; iodide
benzyl 5-bromo-2-[(4-methoxyphenyl)ethynyl]phenylcarbamate
diethyl (2-formyl-4-methylphenyl) phosphate