三螺旋の形成は、三本目のDNA鎖(三鎖を形成するオリゴヌクレオチド、TFO)と二本鎖DNAとの結合に関連する。TFOの設計方式は,Hoogsteen塩基対により二本鎖DNAに特異的に認識され結合する標的配列である。あなたの問題では,このTFOは二本鎖DNAから反転したシトシンと相互作用するために設計されている可能性が高い。
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Toluene-4-sulfonic acid 4-((2S,4S,5R)-4-methoxymethoxy-5-trityloxymethyl-tetrahydro-furan-2-yl)-butyl ester